科研服務(wù) 時(shí)間：2020-07-17 17:31:00 瀏覽：29562次
轉(zhuǎn)錄組測序
轉(zhuǎn)錄組測序是基于HiSeq平臺，對待特定組織或者細(xì)胞在某個(gè)時(shí)期轉(zhuǎn)錄出來的所有mRNA進(jìn)行測序，即可研究已知基因，亦能發(fā)掘新基因，全面快速地獲得mRNA序列和風(fēng)度信息。
案例分析
案 例 通過RNAseq技術(shù)全面解析乳腺癌組織中的可變剪切形式
乳腺癌組織由特定形式的轉(zhuǎn)錄本發(fā)揮特殊功能，本研究應(yīng)用RNAseq技術(shù)獲得了三種典型乳腺癌組織TNBC、non-TNBC和HER2陽性乳腺癌的轉(zhuǎn)錄本信息。該研究發(fā)現(xiàn)了新可變剪切形式和可變剪切后的新轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，乳腺癌組織與正常乳腺組織在轉(zhuǎn)錄本表達(dá)水平和啟動子轉(zhuǎn)移水平存在顯著差異，并RT-PCR驗(yàn)證CDK4，LARP1
,
ADD3和PHLPP2等轉(zhuǎn)錄本形式。該研究第一次系統(tǒng)研究了不同亞型乳腺癌組織轉(zhuǎn)錄本利用可變剪切形式和轉(zhuǎn)錄本特異表達(dá)的情況。
長鏈非編碼RNA測序
長鏈非編碼RNA（long
noncoding RNA, lncRNA）是一類長度超過200
nt的長鏈非編碼RNA，通過與DNA、RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合，在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等水平調(diào)控基因表達(dá)。
測序采用Illumina
HiSeq平臺進(jìn)行測序，針對有參考基因組樣本開展準(zhǔn)確的lncRNA鑒定
和lncRNA靶基因預(yù)測，同時(shí)提供針對測序數(shù)據(jù)中mRNA的分析，結(jié)果更全面，廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)研究領(lǐng)域。
長鏈非編碼RNA測序的特點(diǎn)：
LncRNA的研究作為RNA研究的新領(lǐng)域，在生產(chǎn)、生活、健康方面具有重要意義，可通過不同的分子生物學(xué)機(jī)制調(diào)控編碼基因的表達(dá)，在生產(chǎn)上對物種的改良，在人類健康方面參與疾病相關(guān)的信號通路從而對疾病的發(fā)生發(fā)展及治療有重要作用。長鏈非編碼RNA測序操作步驟：
1、研究對象的選??；
2、提取RNA，RNA量≥2.0ug;
3、鏈特異性文庫的構(gòu)建；
4、PE150測序（12-24Gb）;
5、信息分析，利用六步法對lncRNA進(jìn)行準(zhǔn)確篩選，高效預(yù)測靶基因，并完成對轉(zhuǎn)錄本中mRNA的分析，以及l(fā)ncRNA和mRNA的比較分析、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。
四、客戶提供目的樣本：
如動物組織、細(xì)胞等以及相關(guān)的樣本信息，需要干冰運(yùn)輸
五、服務(wù)周期：
65天
威斯騰實(shí)驗(yàn)服務(wù)流程
威斯騰生物服務(wù)項(xiàng)目
| 分子生物學(xué)檢測 | 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) | 動物實(shí)驗(yàn) |
| 實(shí)時(shí)熒光定量PCR | 單克隆抗體制備 | 帕金森疾病模型 |
| 免疫共沉淀（Co-IP） | 多克隆抗體制備 | 抑郁癥動物模型 |
| ELISA（酶聯(lián)免疫吸附法）技術(shù) | Western-blot 實(shí)驗(yàn)服務(wù) | 脊髓損傷模型 |
| 生化指標(biāo)檢測 | 蛋白雙向電泳實(shí)驗(yàn)服務(wù) | 腦外損傷模型 |
| 雙熒光素酶報(bào)告基因檢測 | 原核蛋白表達(dá)純化 | 骨神經(jīng)損傷模型 |
| 染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP） | 真核蛋白表達(dá)純化 | 心肌缺血模型 |
| GST pull Down | ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) | 心力衰竭模型 |
| SLAC蛋白組學(xué) | 肺動脈高血壓動物模型 | |
| 高血壓模型 | ||
| 病毒包裝 | 實(shí)驗(yàn)課題整體外包 | 粥樣動脈硬化模型 |
| 過表達(dá)/干擾慢病毒包裝純化 | 整體課題外包 | 大腦中動脈阻塞模型 |
| 過表達(dá)/干擾腺病毒包裝純化 | 細(xì)胞整體實(shí)驗(yàn)外包 | 慢性之氣管炎模型 |
| 逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 | 動物整體實(shí)驗(yàn)外包 | 過敏性哮喘模型 |
| 腺相關(guān)病毒包裝純化 | 肺炎大鼠模型 | |
| 肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
| 蛋白芯片 | 原代細(xì)胞培養(yǎng) | 肝纖維化模型 |
| 細(xì)胞因子芯片 | 骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng) | 膽結(jié)石模型 |
| BioPlex懸浮芯片 | 脂肪干細(xì)胞培養(yǎng) | 急性胰腺炎模型 |
| 生長因子芯片 | 心肌成纖維細(xì)胞培養(yǎng) | 急性腎衰竭模型 |
| 炎癥因子芯片 | 軟骨細(xì)胞培養(yǎng) | 體內(nèi)血栓模型 |
| 血管生成因子芯片 | 血管內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng) | 關(guān)節(jié)炎模型 |
| 凋亡因子芯片 | 神經(jīng)元細(xì)胞培養(yǎng) | I型和II型糖尿病模型 |
| 趨化因子芯片 | 內(nèi)皮組細(xì)胞原代培養(yǎng) | 裸鼠成瘤 |
| HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 | 基因編輯動物 | |
| 電生理相關(guān)服務(wù) | 動物整體實(shí)驗(yàn)服務(wù) | |
| 膜片鉗實(shí)驗(yàn) | ||
| 細(xì)胞生物學(xué)檢測 | 高通量測序 | 代謝組學(xué) |
| 細(xì)胞原代培養(yǎng) | mRNA測序 | 氣相色譜GC/MS |
| MTT檢測 | LncRNA測序 | 液相色譜LC/MS |
| 細(xì)胞凋亡檢測 | 全基因組測序 | 核磁共震NMR |
| 細(xì)胞周期檢測 | RNA-Seq測序 | |
| 細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn) | 外顯子測序 | 影像學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn) |
| Transwell細(xì)胞遷移/侵襲 | 16s擴(kuò)增子測序 | Micro-CT |
| 流式分選 | Small RNA測序 | 小動物活體成像 |
| CCK8/XTT檢測 | 宏基因組測序 | 核磁共振 |
| 臺盼藍(lán)檢測細(xì)胞活性 | 單細(xì)胞測序 | PET-CT |
| 藥物篩選細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn) | circleRNA測序 | |
| 細(xì)胞粘附性檢測 | 甲基化測序 | 基因編輯動物 |
| 細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn) | 條件性敲除小鼠/大鼠 | |
| 細(xì)胞生物學(xué)整體實(shí)驗(yàn) | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
| 細(xì)胞成管實(shí)驗(yàn) | ||
| 病理檢測 | CRISPR/Cas9細(xì)胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
| 掃描電鏡 | 基因定點(diǎn)突變細(xì)胞系 | LncRNA芯片 |
| 透射電鏡 | 單基因敲除細(xì)胞系 | miRNA芯片 |
| HE染色 | 多基因敲除細(xì)胞系 | mRNA芯片 |
| 免疫組化 | 目的基因敲入細(xì)胞系 | 甲基化芯片（限人和小鼠來源樣本） |
| Tunel（原位末端凋亡法）檢測 | 報(bào)告基因敲入細(xì)胞系 | SNP芯片（限人和小鼠來源樣本） |
| 激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除細(xì)胞系 | |
| 免疫熒光 | ||
| Masson染色 | CRISPR/Cas9動物敲除/敲入 | |
| 原位雜交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | |
| 熒光原位雜交 | 基因敲入大鼠/小鼠 | |
| 特殊染色（PSA、茜素紅、阿爾新藍(lán)等） |
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| 行為學(xué)檢測 | 藥物篩選服務(wù)項(xiàng)目 | 藥效學(xué)評價(jià) |
| 曠場實(shí)驗(yàn) | 高通量自動藥物篩選平臺 | 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評價(jià) |
| 重復(fù)性刻板行為檢測 | 細(xì)胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺 | 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià) |
| 動物跑臺檢測 | 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)研發(fā)平臺 | 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià) |
| 強(qiáng)迫游泳 | 分子藥理研究平臺 | 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià) |
| 生物膜片鉗藥物篩選平臺 | 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評價(jià) | |
| 常規(guī)藥物體外篩選 |
【本平臺合作項(xiàng)目】
分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、基因敲出/入、模式動物、SPF動物保種、病理學(xué)檢測、免疫學(xué)檢測、影像學(xué)檢測、原代培養(yǎng)、細(xì)胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、高通量高內(nèi)涵篩選、藥效學(xué)評價(jià)、藥理毒理學(xué)實(shí)驗(yàn)、慢病毒包裝與穩(wěn)轉(zhuǎn)株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學(xué)分析、知識產(chǎn)權(quán)服務(wù)！
【全國免費(fèi)熱線】400-675-6758
【電話】 023-65316016,023-65316556
【郵箱】 china-western@163.com
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