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熒光定量PCR(也稱TaqMan
PCR,以下簡稱FQ-PCR)是美國PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出來的一種新的核酸定量技術(shù),該技術(shù)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上加入熒光標(biāo)記探針來實(shí)現(xiàn)其定量功能的,與變通PCR相比,F(xiàn)Q-PCR具有許多優(yōu)點(diǎn)。與普通PCR相比,F(xiàn)Q-PCR具有許多優(yōu)點(diǎn):1、封閉反應(yīng),無需PCR后處理。2、特異性強(qiáng),靈敏度高。3、采用對數(shù)期分析,摒棄終點(diǎn)數(shù)據(jù),定量準(zhǔn)確。4、定量范圍寬,可達(dá)到10個(gè)數(shù)量級。5、儀器在線式實(shí)時(shí)檢測,結(jié)果直觀,避免人為判斷。6、可實(shí)現(xiàn)一管雙檢或多檢。7、操作安全,縮短時(shí)間,提高效率。熒光定量 PCR是 通過對 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)中每一個(gè)循環(huán)產(chǎn)物熒光信號的實(shí)時(shí)檢測從而實(shí)現(xiàn)對起始模板定量及定性的分析。
熒光定量PCR分類:
☆TaqMan熒光探針
PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5‘-3‘外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。
☆SYBR Green熒光染料
SYBR
Green是一種DNA結(jié)合染料,能非特異地?fù)饺氲诫p鏈DNA中去。在游離狀態(tài)下,它不發(fā)出熒光,但一旦結(jié)合到雙鏈DNA中以后,便可以發(fā)出熒光。它的最大優(yōu)點(diǎn)就是可以與任意引物、模板相配合,用于任意反應(yīng)體系中。從經(jīng)濟(jì)角度考慮,它也比其它的探針的價(jià)格要便宜得多。但由于它能與所有的雙鏈DNA結(jié)合,所以一旦反應(yīng)體系中出現(xiàn)非特異擴(kuò)增,那它就會(huì)影響到定量結(jié)果的可靠性與重復(fù)性。要避免這種不利因素,可以通過選擇良好的引物并優(yōu)化反應(yīng)條件以消除非特異性影響。
●主要實(shí)驗(yàn)步驟如下:
RT-qPCR是由三個(gè)步驟組成:
1.反轉(zhuǎn)錄:依賴反轉(zhuǎn)錄酶將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNDA;
2.擴(kuò)增:用PCR的方法擴(kuò)增cDNA;
3.檢測:實(shí)時(shí)檢測和定量擴(kuò)增的產(chǎn)物.
具體實(shí)驗(yàn)操作步驟:
1.設(shè)計(jì)并合成Realtime PCR引物。
2.引物溶解后使用Promega的TaqDNA聚合酶進(jìn)行含SG(SYBR?; Green)的PCR反應(yīng)的優(yōu)化。
3.客戶樣品RNA抽提
實(shí)驗(yàn)對象為組織樣品,取適量(50-100mg)新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),勻漿后抽提RNA。
實(shí)驗(yàn)對象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1×106~1×107細(xì)胞,PBS清洗細(xì)胞,去PBS加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA 。
4.RNA質(zhì)量檢測
a.紫外吸收測定法測定RNA在分光光度計(jì)260nm和280nm處的吸收值,以計(jì)算其濃度并評估RNA純度 。
b.使用ambion公司的甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA純度及完整性。
5.使用逆轉(zhuǎn)錄酶(Promega)進(jìn)行反應(yīng),將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。
6.制備標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品:
進(jìn)行相對定量,需要先將樣品的目的基因以及管家基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其產(chǎn)物進(jìn)行梯度稀釋用于做標(biāo)準(zhǔn)曲線。
7.標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品和待測樣品分別加入到含SG的RealTime PCR反應(yīng)液中,進(jìn)行RealTime
PCR擴(kuò)增和檢測。
8.檢測結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)曲線分析:以對待測樣品的目的基因進(jìn)行定量。相對定量實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)一步用樣品的目的基因測得值除以管家基因測得值以校正誤差,所得結(jié)果代表某樣品的目的基因相對含量。
9.提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告:包括詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)方法及實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果的相關(guān)圖表 。
熒光定量PCR中的一些術(shù)語
1.CT值:熒光信號有統(tǒng)計(jì)意義顯著增長(即穿過閾值線)時(shí)的循環(huán)次數(shù),或者說是從基線到指數(shù)增長的拐點(diǎn)所對應(yīng)的循環(huán)次數(shù)。
2.閾值:閾值的默認(rèn)設(shè)置是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。
3.CT值與起始模板的量成線性關(guān)系。
客戶須知:
1、請您提供新鮮的且盡量多的材料,或直接提供純化好的總RNA或DNA(大于5ug/樣本)。如是如織:100-200mg
2、請通過EMAIL提供已知的全長基因序列。
3、請?zhí)峁┰敿?xì)背景資料:DNA/RNA來源,豐度。
結(jié)果提供:
1、實(shí)驗(yàn)詳細(xì)步驟,和相關(guān)數(shù)據(jù)。
2、標(biāo)準(zhǔn)曲線,擴(kuò)增曲線,溶解曲線。
3、完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告(含軟件分析結(jié)果)
威斯騰服務(wù)流程:
十、威斯騰生物服務(wù)項(xiàng)目:
分子生物學(xué)檢測 | 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) | 動(dòng)物實(shí)驗(yàn) |
實(shí)時(shí)熒光定量PCR | 單克隆抗體制備 | 帕金森疾病模型 |
免疫共沉淀(Co-IP) | 多克隆抗體制備 | 抑郁癥動(dòng)物模型 |
ELISA(酶聯(lián)免疫吸附法)技術(shù) | Western-blot 實(shí)驗(yàn)服務(wù) | 脊髓損傷模型 |
生化指標(biāo)檢測 | 蛋白雙向電泳實(shí)驗(yàn)服務(wù) | 腦外損傷模型 |
雙熒光素酶報(bào)告基因檢測 | 原核蛋白表達(dá)純化 | 骨神經(jīng)損傷模型 |
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP) | 真核蛋白表達(dá)純化 | 心肌缺血模型 |
GST pull Down | ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) | 心力衰竭模型 |
SLAC蛋白組學(xué) | 肺動(dòng)脈高血壓動(dòng)物模型 | |
高血壓模型 | ||
病毒包裝純化 | 實(shí)驗(yàn)課題整體外包 | 粥樣動(dòng)脈硬化模型 |
過表達(dá)/干擾慢病毒包裝純化 | 整體課題外包 | 大腦中動(dòng)脈阻塞模型 |
過表達(dá)/干擾腺病毒包裝純化 | 細(xì)胞整體實(shí)驗(yàn)外包 | 慢性之氣管炎模型 |
逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 | 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)外包 | 過敏性哮喘模型 |
腺相關(guān)病毒包裝純化 | 肺炎大鼠模型 | |
肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
蛋白芯片 | 原代細(xì)胞培養(yǎng) | 肝纖維化模型 |
細(xì)胞因子芯片 | 骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng) | 膽結(jié)石模型 |
生長因子芯片 | 脂肪干細(xì)胞培養(yǎng) | 急性胰腺炎模型 |
信號通路磷酸化水平檢測芯片 | 心肌成纖維細(xì)胞培養(yǎng) | 急性腎衰竭模型 |
BioPlex懸浮芯片 | 軟骨細(xì)胞培養(yǎng) | 體內(nèi)血栓模型 |
生長因子芯片 | 血管內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng) | 關(guān)節(jié)炎模型 |
炎癥因子芯片 | 神經(jīng)元細(xì)胞培養(yǎng) | I型和II型糖尿病模型 |
血管生成因子芯片 | 內(nèi)皮組細(xì)胞原代培養(yǎng) | 裸鼠成瘤 |
凋亡因子芯片 | 基因編輯動(dòng)物 | |
趨化因子芯片 | 電生理相關(guān)服務(wù) | 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)服務(wù) |
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 | 膜片鉗實(shí)驗(yàn) | |
細(xì)胞生物學(xué) | 高通量測序 | 代謝組學(xué) |
細(xì)胞原代培養(yǎng) | mRNA測序 | 氣相色譜GC/MS |
MTT檢測 | LncRNA測序 | 液相色譜LC/MS |
細(xì)胞凋亡檢測 | 全基因組測序 | 核磁共震NMR |
細(xì)胞周期檢測 | RNA-Seq測序 | |
細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn) | 外顯子測序 | 影像學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn) |
Transwell細(xì)胞遷移/侵襲 | 16s擴(kuò)增子測序 | Micro-CT |
流式分選 | Small RNA測序 | 小動(dòng)物活體成像 |
CCK8/XTT檢測 | 宏基因組測序 | 核磁共振 |
臺盼藍(lán)檢測細(xì)胞活性 | 單細(xì)胞測序 | PET-CT |
藥物篩選細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn) | circleRNA測序 | |
細(xì)胞粘附性檢測 | 甲基化測序 | 基因編輯動(dòng)物 |
細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn) | 條件性敲除小鼠/大鼠 | |
細(xì)胞生物學(xué)整體實(shí)驗(yàn) | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
細(xì)胞成管實(shí)驗(yàn) | ||
病理學(xué)檢測 | CRISPR/Cas9細(xì)胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
掃描電鏡 | 基因定點(diǎn)突變細(xì)胞系 | LncRNA芯片 |
透射電鏡 | 單基因敲除細(xì)胞系 | miRNA芯片 |
HE染色 | 多基因敲除細(xì)胞系 | mRNA芯片 |
免疫組化 | 目的基因敲入細(xì)胞系 | 甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本) |
Tunel(原位末端凋亡法)檢測 | 報(bào)告基因敲入細(xì)胞系 | SNP芯片(限人和小鼠來源樣本) |
激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除細(xì)胞系 | |
免疫熒光 | ||
Masson染色 | CRISPR/Cas9動(dòng)物敲除/敲入 | |
原位雜交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | |
熒光原位雜交 | 基因敲入大鼠/小鼠 | |
特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍(lán)等) | ||
行為學(xué)檢測 | 藥物篩選服務(wù)項(xiàng)目 | 藥效學(xué)評價(jià) |
水迷宮實(shí)驗(yàn) | 高通量自動(dòng)藥物篩選平臺 | 神經(jīng)系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià) |
曠場實(shí)驗(yàn) | 細(xì)胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺 | 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評價(jià) |
重復(fù)性刻板行為檢測 | 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)研發(fā)平臺 | 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià) |
動(dòng)物跑臺檢測 | 分子藥理研究平臺 | 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià) |
強(qiáng)迫游泳 | 生物膜片鉗藥物篩選平臺 | 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià) |
常規(guī)藥物體外篩選 | 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評價(jià) |
科研服務(wù)高品質(zhì)供應(yīng)商
全國免費(fèi)熱線:400-675-6758
公司總部:重慶高新區(qū)生物醫(yī)藥研發(fā)產(chǎn)業(yè)園
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