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分子生物學(xué)檢測
熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)對外服務(wù)

時(shí)間:2020-07-21 13:46:00 瀏覽:32001次


熒光定量PCR(也稱TaqMan PCR,以下簡稱FQ-PCR)是美國PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出來的一種新的核酸定量技術(shù),該技術(shù)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上加入熒光標(biāo)記探針來實(shí)現(xiàn)其定量功能的,與變通PCR相比,F(xiàn)Q-PCR具有許多優(yōu)點(diǎn)。與普通PCR相比,F(xiàn)Q-PCR具有許多優(yōu)點(diǎn):1、封閉反應(yīng),無需PCR后處理。2、特異性強(qiáng),靈敏度高。3、采用對數(shù)期分析,摒棄終點(diǎn)數(shù)據(jù),定量準(zhǔn)確。4、定量范圍寬,可達(dá)到10個(gè)數(shù)量級。5、儀器在線式實(shí)時(shí)檢測,結(jié)果直觀,避免人為判斷。6、可實(shí)現(xiàn)一管雙檢或多檢。7、操作安全,縮短時(shí)間,提高效率。熒光定量 PCR是 通過對 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)中每一個(gè)循環(huán)產(chǎn)物熒光信號的實(shí)時(shí)檢測從而實(shí)現(xiàn)對起始模板定量及定性的分析。

熒光定量PCR分類:
☆TaqMan熒光探針
PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5‘-3‘外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。
☆SYBR Green熒光染料
SYBR Green是一種DNA結(jié)合染料,能非特異地?fù)饺氲诫p鏈DNA中去。在游離狀態(tài)下,它不發(fā)出熒光,但一旦結(jié)合到雙鏈DNA中以后,便可以發(fā)出熒光。它的最大優(yōu)點(diǎn)就是可以與任意引物、模板相配合,用于任意反應(yīng)體系中。從經(jīng)濟(jì)角度考慮,它也比其它的探針的價(jià)格要便宜得多。但由于它能與所有的雙鏈DNA結(jié)合,所以一旦反應(yīng)體系中出現(xiàn)非特異擴(kuò)增,那它就會(huì)影響到定量結(jié)果的可靠性與重復(fù)性。要避免這種不利因素,可以通過選擇良好的引物并優(yōu)化反應(yīng)條件以消除非特異性影響。


●主要實(shí)驗(yàn)步驟如下:

RT-qPCR是由三個(gè)步驟組成:
1.反轉(zhuǎn)錄:依賴反轉(zhuǎn)錄酶將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNDA;
2.擴(kuò)增:用PCR的方法擴(kuò)增cDNA;
3.檢測:實(shí)時(shí)檢測和定量擴(kuò)增的產(chǎn)物.


具體實(shí)驗(yàn)操作步驟:

1.設(shè)計(jì)并合成Realtime PCR引物。
2.引物溶解后使用Promega的TaqDNA聚合酶進(jìn)行含SG(SYBR?; Green)的PCR反應(yīng)的優(yōu)化。
3.客戶樣品RNA抽提
實(shí)驗(yàn)對象為組織樣品,取適量(50-100mg)新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),勻漿后抽提RNA。
實(shí)驗(yàn)對象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1×106~1×107細(xì)胞,PBS清洗細(xì)胞,去PBS加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA 。
4.RNA質(zhì)量檢測
a.紫外吸收測定法測定RNA在分光光度計(jì)260nm和280nm處的吸收值,以計(jì)算其濃度并評估RNA純度 。
b.使用ambion公司的甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA純度及完整性。
5.使用逆轉(zhuǎn)錄酶(Promega)進(jìn)行反應(yīng),將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。
6.制備標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品:
進(jìn)行相對定量,需要先將樣品的目的基因以及管家基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其產(chǎn)物進(jìn)行梯度稀釋用于做標(biāo)準(zhǔn)曲線。
7.標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品和待測樣品分別加入到含SG的RealTime PCR反應(yīng)液中,進(jìn)行RealTime PCR擴(kuò)增和檢測。
8.檢測結(jié)果進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)曲線分析:以對待測樣品的目的基因進(jìn)行定量。相對定量實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)一步用樣品的目的基因測得值除以管家基因測得值以校正誤差,所得結(jié)果代表某樣品的目的基因相對含量。
9.提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告:包括詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)方法及實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果的相關(guān)圖表 。


熒光定量PCR中的一些術(shù)語

1.CT值:熒光信號有統(tǒng)計(jì)意義顯著增長(即穿過閾值線)時(shí)的循環(huán)次數(shù),或者說是從基線到指數(shù)增長的拐點(diǎn)所對應(yīng)的循環(huán)次數(shù)。

2.閾值:閾值的默認(rèn)設(shè)置是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。

3.CT值與起始模板的量成線性關(guān)系。





客戶須知:

1、請您提供新鮮的且盡量多的材料,或直接提供純化好的總RNA或DNA(大于5ug/樣本)。如是如織:100-200mg

2、請通過EMAIL提供已知的全長基因序列。

3、請?zhí)峁┰敿?xì)背景資料:DNA/RNA來源,豐度。


結(jié)果提供:

1、實(shí)驗(yàn)詳細(xì)步驟,和相關(guān)數(shù)據(jù)。

2、標(biāo)準(zhǔn)曲線,擴(kuò)增曲線,溶解曲線。

3、完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告(含軟件分析結(jié)果)


威斯騰服務(wù)流程:



十、威斯騰生物服務(wù)項(xiàng)目:

分子生物學(xué)檢測 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
實(shí)時(shí)熒光定量PCR 單克隆抗體制備 帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP) 多克隆抗體制備 抑郁癥動(dòng)物模型
ELISA(酶聯(lián)免疫吸附法)技術(shù) Western-blot 實(shí)驗(yàn)服務(wù) 脊髓損傷模型
生化指標(biāo)檢測 蛋白雙向電泳實(shí)驗(yàn)服務(wù) 腦外損傷模型
雙熒光素酶報(bào)告基因檢測 原核蛋白表達(dá)純化 骨神經(jīng)損傷模型
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP) 真核蛋白表達(dá)純化 心肌缺血模型
GST pull Down ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) 心力衰竭模型

SLAC蛋白組學(xué) 肺動(dòng)脈高血壓動(dòng)物模型


高血壓模型
病毒包裝純化 實(shí)驗(yàn)課題整體外包 粥樣動(dòng)脈硬化模型
過表達(dá)/干擾慢病毒包裝純化 整體課題外包 大腦中動(dòng)脈阻塞模型
過表達(dá)/干擾腺病毒包裝純化 細(xì)胞整體實(shí)驗(yàn)外包 慢性之氣管炎模型
逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)外包 過敏性哮喘模型
腺相關(guān)病毒包裝純化
肺炎大鼠模型


肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片 原代細(xì)胞培養(yǎng) 肝纖維化模型
細(xì)胞因子芯片 骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng) 膽結(jié)石模型
生長因子芯片 脂肪干細(xì)胞培養(yǎng) 急性胰腺炎模型
信號通路磷酸化水平檢測芯片 心肌成纖維細(xì)胞培養(yǎng) 急性腎衰竭模型
BioPlex懸浮芯片 軟骨細(xì)胞培養(yǎng) 體內(nèi)血栓模型
生長因子芯片 血管內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng) 關(guān)節(jié)炎模型
炎癥因子芯片 神經(jīng)元細(xì)胞培養(yǎng) I型和II型糖尿病模型
血管生成因子芯片 內(nèi)皮組細(xì)胞原代培養(yǎng) 裸鼠成瘤
凋亡因子芯片
基因編輯動(dòng)物
趨化因子芯片 電生理相關(guān)服務(wù) 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)服務(wù)
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 膜片鉗實(shí)驗(yàn)
細(xì)胞生物學(xué) 高通量測序 代謝組學(xué)
細(xì)胞原代培養(yǎng) mRNA測序 氣相色譜GC/MS
MTT檢測 LncRNA測序 液相色譜LC/MS
細(xì)胞凋亡檢測 全基因組測序 核磁共震NMR
細(xì)胞周期檢測 RNA-Seq測序
細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn) 外顯子測序 影像學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn)
Transwell細(xì)胞遷移/侵襲 16s擴(kuò)增子測序 Micro-CT
流式分選 Small RNA測序 小動(dòng)物活體成像
CCK8/XTT檢測 宏基因組測序 核磁共振
臺盼藍(lán)檢測細(xì)胞活性 單細(xì)胞測序 PET-CT
藥物篩選細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn) circleRNA測序
細(xì)胞粘附性檢測 甲基化測序 基因編輯動(dòng)物
細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)
條件性敲除小鼠/大鼠
細(xì)胞生物學(xué)整體實(shí)驗(yàn)
全基因敲除小鼠/大鼠
細(xì)胞成管實(shí)驗(yàn)

病理學(xué)檢測 CRISPR/Cas9細(xì)胞敲除/敲入 基因芯片
掃描電鏡 基因定點(diǎn)突變細(xì)胞系 LncRNA芯片
透射電鏡 單基因敲除細(xì)胞系 miRNA芯片
HE染色 多基因敲除細(xì)胞系 mRNA芯片
免疫組化 目的基因敲入細(xì)胞系 甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
Tunel(原位末端凋亡法)檢測 報(bào)告基因敲入細(xì)胞系 SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
激光共聚焦 miRNA/LncRNA敲除細(xì)胞系
免疫熒光

Masson染色 CRISPR/Cas9動(dòng)物敲除/敲入
原位雜交 基因敲除大鼠/小鼠
熒光原位雜交 基因敲入大鼠/小鼠
特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍(lán)等)

行為學(xué)檢測 藥物篩選服務(wù)項(xiàng)目 藥效學(xué)評價(jià)
水迷宮實(shí)驗(yàn) 高通量自動(dòng)藥物篩選平臺 神經(jīng)系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià)
曠場實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評價(jià)
重復(fù)性刻板行為檢測 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)研發(fā)平臺 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià)
動(dòng)物跑臺檢測 分子藥理研究平臺 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià)
強(qiáng)迫游泳 生物膜片鉗藥物篩選平臺 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價(jià)

常規(guī)藥物體外篩選 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評價(jià)


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