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長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA。通過與DNA、RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合，在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等水平調(diào)控基因表達(dá)，與人類疾病發(fā)生發(fā)展有密切聯(lián)系。lncRNA-seq主要分析研究細(xì)胞或者組織在某個特定時期轉(zhuǎn)錄出的所有lncRNA和mRNA。

技術(shù)路線

案例分析

采用RNA-seq測序技術(shù)，對14個中國前列腺癌病人的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行全面分析，結(jié)果在每個樣本中平均發(fā)現(xiàn)了1599個已知的lncRNA。通過腫瘤樣本和正常樣本進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)了406個有差異表達(dá)的lncRNA。該研究找到了中國人群特異的融合基因，同時還鑒定了大量的差異表達(dá)的lncRNA。通過對lncRNA和基因表達(dá)的關(guān)系分析顯示，lncRNA有可能有轉(zhuǎn)錄調(diào)控之外的其他功能。這些研究結(jié)果為進(jìn)一步了解前列腺癌的診斷、發(fā)病演化機(jī)制和種族差異性提供了新的線索。

圖1 137個差異表達(dá)的lncRNA對基因表達(dá)的分析

圖2 lncRNA中的DD3，FR0257520，FR0348383，MALAT1在前列腺癌和正常對比

參考文獻(xiàn)

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