
時(shí)間:2020-07-21 15:35:00 瀏覽:29035次
均一化cDNA文庫(kù)是克服基因轉(zhuǎn)錄水平上巨大差異給文庫(kù)的篩選和分析帶來(lái)障礙的有效措施,有利于研究基因的表達(dá)和分析。現(xiàn)在,在構(gòu)建均一化cDNA文庫(kù)中至少有兩種主要的觀點(diǎn)。一種是基于復(fù)性動(dòng)力學(xué)的原理,高豐度的cDNA在退火下復(fù)性速度快,而低豐度的cDNA復(fù)性要很長(zhǎng)時(shí)間,從而可以通過(guò)控制復(fù)性時(shí)間來(lái)降低豐度;另一種是基于基因組DNA在拷貝數(shù)上具有相對(duì)均一化的性質(zhì),通過(guò)cDNA和DNA的飽和雜交而降低在文庫(kù)中高拷貝存在的cDNA的豐度。我們主要通過(guò)第一種方法實(shí)現(xiàn)均一化,以達(dá)到降低基因間拷貝數(shù)差異,有助于低拷貝基因的篩選。
操作流程
均一化cDNA文庫(kù)的鑒定
檢測(cè)庫(kù)容量(總CFU);隨機(jī)挑取32個(gè)克隆子,PCR方法檢測(cè)平均插入片段大?。怀樘峋换痗DNA文庫(kù)的混合質(zhì)粒(大抽),qPCR檢測(cè)均一化前后兩個(gè)文庫(kù)總質(zhì)粒中兩個(gè)看家基因的表達(dá)量差異,以判斷均一化的效果。
送樣要求
針對(duì)每個(gè)文庫(kù),客戶需提供200ug以上的RNA或2g以上的組織樣本。
結(jié)果提供
我們提供構(gòu)建好的cDNA文庫(kù)的甘油菌液(含20%甘油的LB培養(yǎng)基),隨機(jī)克隆子的PCR鑒定圖譜,文庫(kù)構(gòu)建報(bào)告。
威斯騰實(shí)驗(yàn)服務(wù)流程
威斯騰生物服務(wù)項(xiàng)目
分子生物學(xué)檢測(cè) | 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) | 動(dòng)物實(shí)驗(yàn) |
實(shí)時(shí)熒光定量PCR | 單克隆抗體制備 | 帕金森疾病模型 |
免疫共沉淀(Co-IP) | 多克隆抗體制備 | 抑郁癥動(dòng)物模型 |
ELISA(酶聯(lián)免疫吸附法)技術(shù) | Western-blot 實(shí)驗(yàn)服務(wù) | 脊髓損傷模型 |
生化指標(biāo)檢測(cè) | 蛋白雙向電泳實(shí)驗(yàn)服務(wù) | 腦外損傷模型 |
雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè) | 原核蛋白表達(dá)純化 | 骨神經(jīng)損傷模型 |
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP) | 真核蛋白表達(dá)純化 | 心肌缺血模型 |
GST pull Down | ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) | 心力衰竭模型 |
SLAC蛋白組學(xué) | 肺動(dòng)脈高血壓動(dòng)物模型 | |
高血壓模型 | ||
病毒包裝 | 實(shí)驗(yàn)課題整體外包 | 粥樣動(dòng)脈硬化模型 |
過(guò)表達(dá)/干擾慢病毒包裝純化 | 整體課題外包 | 大腦中動(dòng)脈阻塞模型 |
過(guò)表達(dá)/干擾腺病毒包裝純化 | 細(xì)胞整體實(shí)驗(yàn)外包 | 慢性之氣管炎模型 |
逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 | 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)外包 | 過(guò)敏性哮喘模型 |
腺相關(guān)病毒包裝純化 | 肺炎大鼠模型 | |
肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
蛋白芯片 | 原代細(xì)胞培養(yǎng) | 肝纖維化模型 |
細(xì)胞因子芯片 | 骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng) | 膽結(jié)石模型 |
BioPlex懸浮芯片 | 脂肪干細(xì)胞培養(yǎng) | 急性胰腺炎模型 |
生長(zhǎng)因子芯片 | 心肌成纖維細(xì)胞培養(yǎng) | 急性腎衰竭模型 |
炎癥因子芯片 | 軟骨細(xì)胞培養(yǎng) | 體內(nèi)血栓模型 |
血管生成因子芯片 | 血管內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng) | 關(guān)節(jié)炎模型 |
凋亡因子芯片 | 神經(jīng)元細(xì)胞培養(yǎng) | I型和II型糖尿病模型 |
趨化因子芯片 | 內(nèi)皮組細(xì)胞原代培養(yǎng) | 裸鼠成瘤 |
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 | 基因編輯動(dòng)物 | |
電生理相關(guān)服務(wù) | 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)服務(wù) | |
膜片鉗實(shí)驗(yàn) | ||
細(xì)胞生物學(xué)檢測(cè) | 高通量測(cè)序 | 代謝組學(xué) |
細(xì)胞原代培養(yǎng) | mRNA測(cè)序 | 氣相色譜GC/MS |
MTT檢測(cè) | LncRNA測(cè)序 | 液相色譜LC/MS |
細(xì)胞凋亡檢測(cè) | 全基因組測(cè)序 | 核磁共震NMR |
細(xì)胞周期檢測(cè) | RNA-Seq測(cè)序 | |
細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn) | 外顯子測(cè)序 | 影像學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn) |
Transwell細(xì)胞遷移/侵襲 | 16s擴(kuò)增子測(cè)序 | Micro-CT |
流式分選 | Small RNA測(cè)序 | 小動(dòng)物活體成像 |
CCK8/XTT檢測(cè) | 宏基因組測(cè)序 | 核磁共振 |
臺(tái)盼藍(lán)檢測(cè)細(xì)胞活性 | 單細(xì)胞測(cè)序 | PET-CT |
藥物篩選細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn) | circleRNA測(cè)序 | |
細(xì)胞粘附性檢測(cè) | 甲基化測(cè)序 | 基因編輯動(dòng)物 |
細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn) | 條件性敲除小鼠/大鼠 | |
細(xì)胞生物學(xué)整體實(shí)驗(yàn) | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
細(xì)胞成管實(shí)驗(yàn) | ||
病理檢測(cè) | CRISPR/Cas9細(xì)胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
掃描電鏡 | 基因定點(diǎn)突變細(xì)胞系 | LncRNA芯片 |
透射電鏡 | 單基因敲除細(xì)胞系 | miRNA芯片 |
HE染色 | 多基因敲除細(xì)胞系 | mRNA芯片 |
免疫組化 | 目的基因敲入細(xì)胞系 | 甲基化芯片(限人和小鼠來(lái)源樣本) |
Tunel(原位末端凋亡法)檢測(cè) | 報(bào)告基因敲入細(xì)胞系 | SNP芯片(限人和小鼠來(lái)源樣本) |
激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除細(xì)胞系 | |
免疫熒光 | ||
Masson染色 | CRISPR/Cas9動(dòng)物敲除/敲入 |
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原位雜交 | 基因敲除大鼠/小鼠 |
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熒光原位雜交 | 基因敲入大鼠/小鼠 |
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特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍(lán)等) |
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行為學(xué)檢測(cè) | 藥物篩選服務(wù)項(xiàng)目 | 藥效學(xué)評(píng)價(jià) |
曠場(chǎng)實(shí)驗(yàn) | 高通量自動(dòng)藥物篩選平臺(tái) | 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià) |
重復(fù)性刻板行為檢測(cè) | 細(xì)胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺(tái) | 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià) |
動(dòng)物跑臺(tái)檢測(cè) | 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)研發(fā)平臺(tái) | 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià) |
強(qiáng)迫游泳 | 分子藥理研究平臺(tái) | 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià) |
生物膜片鉗藥物篩選平臺(tái) | 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià) | |
常規(guī)藥物體外篩選 |
【本平臺(tái)合作項(xiàng)目】
分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、基因敲出/入、模式動(dòng)物、SPF動(dòng)物保種、病理學(xué)檢測(cè)、免疫學(xué)檢測(cè)、影像學(xué)檢測(cè)、原代培養(yǎng)、細(xì)胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測(cè)序、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、高通量高內(nèi)涵篩選、藥效學(xué)評(píng)價(jià)、藥理毒理學(xué)實(shí)驗(yàn)、慢病毒包裝與穩(wěn)轉(zhuǎn)株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學(xué)分析、知識(shí)產(chǎn)權(quán)服務(wù)!
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