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威斯騰公眾號(hào)

CHIP-seq

時(shí)間:2020-07-21 15:08:00 瀏覽:49395次


ChIP-seq采用特異性抗體對(duì)目的蛋白進(jìn)行免疫沉淀后,分離與其結(jié)合的基因組DNA片段,并通過(guò)高通量測(cè)序,在全基因組范圍內(nèi)尋找目的蛋白特異結(jié)合的DNA位點(diǎn),且可基于多個(gè)樣品進(jìn)行差異比較分析及特異蛋白結(jié)合位點(diǎn)的序列偏好性分析。

技術(shù)路線(xiàn)


案例分析

案 例:雌激素受體結(jié)合異常與乳腺癌臨床試驗(yàn)的相關(guān)性研究
雌激素受體(ER)可與相關(guān)基因結(jié)合形成復(fù)合體并移位到細(xì)胞核結(jié)合下游基因激活它們轉(zhuǎn)錄,為腫瘤生長(zhǎng)助力。在許多乳腺患者體內(nèi),就是因?yàn)樵撌荏w影響了基因的功能,從而引發(fā)致癌連鎖反應(yīng)?,F(xiàn)在常用的他莫昔芬等乳腺癌治療藥物,就是通過(guò)阻斷雌激素受體對(duì)基因的作用而發(fā)揮效果。但在不少患者身上,這種藥物的效果并不理想。本研究基于高通量平臺(tái)的染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ChIP-seq全基因組范圍內(nèi)尋找ER 結(jié)合位點(diǎn),從而鑒定雌激素結(jié)合模式是否在患者腫瘤中存在差異。

 圖1鑒定出的抗他莫昔芬(tamoxifenER結(jié)合位點(diǎn)富集分析

威斯騰生物服務(wù)項(xiàng)目


分子生物學(xué)檢測(cè) 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) 動(dòng)物實(shí)驗(yàn)
實(shí)時(shí)熒光定量PCR 單克隆抗體制備 帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP) 多克隆抗體制備 抑郁癥動(dòng)物模型
ELISA(酶聯(lián)免疫吸附法)技術(shù) Western-blot 實(shí)驗(yàn)服務(wù) 脊髓損傷模型
生化指標(biāo)檢測(cè) 蛋白雙向電泳實(shí)驗(yàn)服務(wù) 腦外損傷模型
雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè) 原核蛋白表達(dá)純化 骨神經(jīng)損傷模型
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP) 真核蛋白表達(dá)純化 心肌缺血模型
GST pull Down ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) 心力衰竭模型

SLAC蛋白組學(xué) 肺動(dòng)脈高血壓動(dòng)物模型


高血壓模型
病毒包裝 實(shí)驗(yàn)課題整體外包 粥樣動(dòng)脈硬化模型
過(guò)表達(dá)/干擾慢病毒包裝純化 整體課題外包 大腦中動(dòng)脈阻塞模型
過(guò)表達(dá)/干擾腺病毒包裝純化 細(xì)胞整體實(shí)驗(yàn)外包 慢性之氣管炎模型
逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)外包 過(guò)敏性哮喘模型
腺相關(guān)病毒包裝純化
肺炎大鼠模型


肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片 原代細(xì)胞培養(yǎng) 肝纖維化模型
細(xì)胞因子芯片 骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng) 膽結(jié)石模型
BioPlex懸浮芯片 脂肪干細(xì)胞培養(yǎng) 急性胰腺炎模型
生長(zhǎng)因子芯片 心肌成纖維細(xì)胞培養(yǎng) 急性腎衰竭模型
炎癥因子芯片 軟骨細(xì)胞培養(yǎng) 體內(nèi)血栓模型
血管生成因子芯片 血管內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng) 關(guān)節(jié)炎模型
凋亡因子芯片 神經(jīng)元細(xì)胞培養(yǎng) I型和II型糖尿病模型
趨化因子芯片 內(nèi)皮組細(xì)胞原代培養(yǎng) 裸鼠成瘤
HuProt TM 20K人類(lèi)蛋白組芯片
基因編輯動(dòng)物

電生理相關(guān)服務(wù) 動(dòng)物整體實(shí)驗(yàn)服務(wù)

膜片鉗實(shí)驗(yàn)
細(xì)胞生物學(xué)檢測(cè) 高通量測(cè)序 代謝組學(xué)
細(xì)胞原代培養(yǎng) mRNA測(cè)序 氣相色譜GC/MS
MTT檢測(cè) LncRNA測(cè)序 液相色譜LC/MS
細(xì)胞凋亡檢測(cè) 全基因組測(cè)序 核磁共震NMR
細(xì)胞周期檢測(cè) RNA-Seq測(cè)序
細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn) 外顯子測(cè)序 影像學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn)
Transwell細(xì)胞遷移/侵襲 16s擴(kuò)增子測(cè)序 Micro-CT
流式分選 Small RNA測(cè)序 小動(dòng)物活體成像
CCK8/XTT檢測(cè) 宏基因組測(cè)序 核磁共振
臺(tái)盼藍(lán)檢測(cè)細(xì)胞活性 單細(xì)胞測(cè)序 PET-CT
藥物篩選細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn) circleRNA測(cè)序
細(xì)胞粘附性檢測(cè) 甲基化測(cè)序 基因編輯動(dòng)物
細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)
條件性敲除小鼠/大鼠
細(xì)胞生物學(xué)整體實(shí)驗(yàn)
全基因敲除小鼠/大鼠
細(xì)胞成管實(shí)驗(yàn)

病理檢測(cè) CRISPR/Cas9細(xì)胞敲除/敲入 基因芯片
掃描電鏡 基因定點(diǎn)突變細(xì)胞系 LncRNA芯片
透射電鏡 單基因敲除細(xì)胞系 miRNA芯片
HE染色 多基因敲除細(xì)胞系 mRNA芯片
免疫組化 目的基因敲入細(xì)胞系 甲基化芯片(限人和小鼠來(lái)源樣本)
Tunel(原位末端凋亡法)檢測(cè) 報(bào)告基因敲入細(xì)胞系 SNP芯片(限人和小鼠來(lái)源樣本)
激光共聚焦 miRNA/LncRNA敲除細(xì)胞系
免疫熒光

Masson染色 CRISPR/Cas9動(dòng)物敲除/敲入
原位雜交 基因敲除大鼠/小鼠
熒光原位雜交 基因敲入大鼠/小鼠
特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍(lán)等)

行為學(xué)檢測(cè) 藥物篩選服務(wù)項(xiàng)目 藥效學(xué)評(píng)價(jià)
曠場(chǎng)實(shí)驗(yàn) 高通量自動(dòng)藥物篩選平臺(tái) 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià)
重復(fù)性刻板行為檢測(cè) 細(xì)胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺(tái) 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià)
動(dòng)物跑臺(tái)檢測(cè) 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)研發(fā)平臺(tái) 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià)
強(qiáng)迫游泳 分子藥理研究平臺(tái) 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià)

生物膜片鉗藥物篩選平臺(tái) 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評(píng)價(jià)

常規(guī)藥物體外篩選

【本平臺(tái)合作項(xiàng)目】
分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、基因敲出/入、模式動(dòng)物、SPF動(dòng)物保種、病理學(xué)檢測(cè)、免疫學(xué)檢測(cè)、影像學(xué)檢測(cè)、原代培養(yǎng)、細(xì)胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測(cè)序、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、高通量高內(nèi)涵篩選、藥效學(xué)評(píng)價(jià)、藥理毒理學(xué)實(shí)驗(yàn)、慢病毒包裝與穩(wěn)轉(zhuǎn)株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學(xué)分析、知識(shí)產(chǎn)權(quán)服務(wù)! 
【全國(guó)免費(fèi)熱線(xiàn)】400-675-6758
【電話(huà)】 023-65316016,023-65316556
【郵箱】 china-western@163.com
【官網(wǎng)網(wǎng)址】m.jnkqjc.com
【地址】 重慶市高新區(qū)二郎創(chuàng)業(yè)大道高科創(chuàng)業(yè)園D棟2樓   

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