
時間:2020-07-21 15:11:00 瀏覽:29695次
全基因組Bisulfite(Whole-genome bisulfite sequencing,WGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測序平臺相結(jié)合,進行全基因組范圍內(nèi)的精確甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態(tài),從而構(gòu)建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。
技術(shù)路線
案例分析
案 例:伯基特淋巴瘤和濾泡淋巴瘤的全基因組甲基化分析揭示與體細胞突變及轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的甲基化差異區(qū)域
對伯基特、濾泡淋巴瘤細胞及正常生發(fā)中心B細胞進行WGBS,與正常B細胞相比,淋巴瘤全基因組處于低甲基化水平,但是在 CpGs島嶼的甲基化水平比正常B細胞高;另外兩種淋巴瘤之間的甲基化水平也存在差異,且在潛在啟動子區(qū)域,隨著基因表達的增強,甲基化水平也有一定的增加。
Kretzmer H, Bernhart S H, Wang W, et al. DNA methylome analysis in Burkitt and follicular lymphomas identifies differentially methylated regions linked to somatic mutation and transcriptional control[J]. Nature genetics, 2015, 47(11): 1316-1325.
威斯騰生物服務(wù)項目
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HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 |
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基因編輯動物 |
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電生理相關(guān)服務(wù) | 動物整體實驗服務(wù) |
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膜片鉗實驗 |
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細胞生物學(xué)檢測 | 高通量測序 | 代謝組學(xué) |
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MTT檢測 | LncRNA測序 | 液相色譜LC/MS |
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全基因敲除小鼠/大鼠 |
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激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除細胞系 |
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免疫熒光 |
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Masson染色 | CRISPR/Cas9動物敲除/敲入 |
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原位雜交 | 基因敲除大鼠/小鼠 |
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熒光原位雜交 | 基因敲入大鼠/小鼠 |
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特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等) |
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行為學(xué)檢測 | 藥物篩選服務(wù)項目 | 藥效學(xué)評價 |
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動物跑臺檢測 | 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標研發(fā)平臺 | 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價 |
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常規(guī)藥物體外篩選 |
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