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基因組/代謝組學(xué)
全基因組DNA甲基化測序

時間:2020-07-21 15:11:00 瀏覽:29695次


全基因組Bisulfite(Whole-genome bisulfite sequencing,WGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測序平臺相結(jié)合,進行全基因組范圍內(nèi)的精確甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態(tài),從而構(gòu)建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。

技術(shù)路線

案例分析

案 例伯基特淋巴瘤和濾泡淋巴瘤的全基因組甲基化分析揭示與體細胞突變及轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的甲基化差異區(qū)域

對伯基特、濾泡淋巴瘤細胞及正常生發(fā)中心B細胞進行WGBS,與正常B細胞相比,淋巴瘤全基因組處于低甲基化水平,但是在 CpGs島嶼的甲基化水平比正常B細胞高;另外兩種淋巴瘤之間的甲基化水平也存在差異,且在潛在啟動子區(qū)域,隨著基因表達的增強,甲基化水平也有一定的增加。

參考文獻

Kretzmer H, Bernhart S H, Wang W, et al. DNA methylome analysis in Burkitt and follicular lymphomas identifies differentially methylated regions linked to somatic mutation and transcriptional control[J]. Nature genetics, 2015, 47(11): 1316-1325.

威斯騰生物服務(wù)項目


分子生物學(xué)檢測 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) 動物實驗
實時熒光定量PCR 單克隆抗體制備 帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP) 多克隆抗體制備 抑郁癥動物模型
ELISA(酶聯(lián)免疫吸附法)技術(shù) Western-blot 實驗服務(wù) 脊髓損傷模型
生化指標檢測 蛋白雙向電泳實驗服務(wù) 腦外損傷模型
雙熒光素酶報告基因檢測 原核蛋白表達純化 骨神經(jīng)損傷模型
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP) 真核蛋白表達純化 心肌缺血模型
GST pull Down ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) 心力衰竭模型

SLAC蛋白組學(xué) 肺動脈高血壓動物模型


高血壓模型
病毒包裝 實驗課題整體外包 粥樣動脈硬化模型
過表達/干擾慢病毒包裝純化 整體課題外包 大腦中動脈阻塞模型
過表達/干擾腺病毒包裝純化 細胞整體實驗外包 慢性之氣管炎模型
逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 動物整體實驗外包 過敏性哮喘模型
腺相關(guān)病毒包裝純化
肺炎大鼠模型


肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片 原代細胞培養(yǎng) 肝纖維化模型
細胞因子芯片 骨髓間充質(zhì)干細胞培養(yǎng) 膽結(jié)石模型
BioPlex懸浮芯片 脂肪干細胞培養(yǎng) 急性胰腺炎模型
生長因子芯片 心肌成纖維細胞培養(yǎng) 急性腎衰竭模型
炎癥因子芯片 軟骨細胞培養(yǎng) 體內(nèi)血栓模型
血管生成因子芯片 血管內(nèi)皮細胞培養(yǎng) 關(guān)節(jié)炎模型
凋亡因子芯片 神經(jīng)元細胞培養(yǎng) I型和II型糖尿病模型
趨化因子芯片 內(nèi)皮組細胞原代培養(yǎng) 裸鼠成瘤
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片
基因編輯動物

電生理相關(guān)服務(wù) 動物整體實驗服務(wù)

膜片鉗實驗
細胞生物學(xué)檢測 高通量測序 代謝組學(xué)
細胞原代培養(yǎng) mRNA測序 氣相色譜GC/MS
MTT檢測 LncRNA測序 液相色譜LC/MS
細胞凋亡檢測 全基因組測序 核磁共震NMR
細胞周期檢測 RNA-Seq測序
細胞克隆形成實驗 外顯子測序 影像學(xué)相關(guān)實驗
Transwell細胞遷移/侵襲 16s擴增子測序 Micro-CT
流式分選 Small RNA測序 小動物活體成像
CCK8/XTT檢測 宏基因組測序 核磁共振
臺盼藍檢測細胞活性 單細胞測序 PET-CT
藥物篩選細胞學(xué)實驗 circleRNA測序
細胞粘附性檢測 甲基化測序 基因編輯動物
細胞劃痕實驗
條件性敲除小鼠/大鼠
細胞生物學(xué)整體實驗
全基因敲除小鼠/大鼠
細胞成管實驗

病理檢測 CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入 基因芯片
掃描電鏡 基因定點突變細胞系 LncRNA芯片
透射電鏡 單基因敲除細胞系 miRNA芯片
HE染色 多基因敲除細胞系 mRNA芯片
免疫組化 目的基因敲入細胞系 甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
Tunel(原位末端凋亡法)檢測 報告基因敲入細胞系 SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
激光共聚焦 miRNA/LncRNA敲除細胞系
免疫熒光

Masson染色 CRISPR/Cas9動物敲除/敲入
原位雜交 基因敲除大鼠/小鼠
熒光原位雜交 基因敲入大鼠/小鼠
特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等)

行為學(xué)檢測 藥物篩選服務(wù)項目 藥效學(xué)評價
曠場實驗 高通量自動藥物篩選平臺 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評價
重復(fù)性刻板行為檢測 細胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價
動物跑臺檢測 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標研發(fā)平臺 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價
強迫游泳 分子藥理研究平臺 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價

生物膜片鉗藥物篩選平臺 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評價

常規(guī)藥物體外篩選

【本平臺合作項目】
分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)、基因敲出/入、模式動物、SPF動物保種、病理學(xué)檢測、免疫學(xué)檢測、影像學(xué)檢測、原代培養(yǎng)、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、高通量高內(nèi)涵篩選、藥效學(xué)評價、藥理毒理學(xué)實驗、慢病毒包裝與穩(wěn)轉(zhuǎn)株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學(xué)分析、知識產(chǎn)權(quán)服務(wù)! 
【全國免費熱線】400-675-6758
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