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基因/蛋白芯片
lncRNA芯片

時間:2020-07-20 14:40:00 瀏覽:46808次


一、lncRNA芯片

長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA) 指的是長度在200-100000 nt之間的RNA分子,它們不編碼蛋白,但參與細胞內(nèi)多種過程調(diào)控。人們對lncRNA的認(rèn)識還處在初級階段,lncRNA起初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來的研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過程,與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展和防治都有著密切的關(guān)系。lncRNA的種類遠遠超過編碼RNA,哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是lncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA的比例是1%-5%)。lncRNA已經(jīng)成為非編碼RNA研究領(lǐng)域的一個熱點。
lncRNA研究的重要一步是發(fā)現(xiàn)與特定疾病相關(guān)的lncRNA。傳統(tǒng)的lncRNA篩選方法(SELEX等)效率低下,假陽性率高。而基因芯片具有覆蓋全面、高效、準(zhǔn)確的特點,因此用基因芯片來篩選lncRNA是一種準(zhǔn)確快捷的方法。

二、lncRNA技術(shù)特點:
1)目前市面上探針密度最高的lncRNA芯片產(chǎn)品;
2)芯片采用Agilent eArray平臺設(shè)計,使用Agilent SurePrint技術(shù)合成,技術(shù)重復(fù)性高于99%;
3)覆蓋主流數(shù)據(jù)庫所有l(wèi)ncRNA,可同時檢測lncRNA和mRNA,并挖掘兩者之間的關(guān)聯(lián);
4)檢出率高:隨機引物擴增方式,可同時擴增帶Ploy-A和不帶Poly-A的lncRNA,確保更多的 lncRNA被檢測出來;
5)提供完整lncRNA芯片數(shù)據(jù)分析解決方案。

三、lncRNA芯片服務(wù)流程:

1、總RNA提??;

2、反轉(zhuǎn)錄合成cDNA;

3、體外轉(zhuǎn)錄合成cRNA;

4、隨機引物合成正義鏈cDNA

5、DNA片段化,生物素標(biāo)記;

6、芯片雜交、洗滌、染色、掃描。

四、樣本要求:細胞、新鮮組織或總RNA樣品

1、提取RNA量≥1ug;

2、細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存。

3、樣品運輸:細胞或者組織樣品;或者總RNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。

五、應(yīng)用:

篩選差異表達的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注釋、lncRNA調(diào)控機制預(yù)測

六、服務(wù)流程



七、服務(wù)項目


分子生物學(xué)類 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) 動物實驗
實時熒光定量PCR 單克隆抗體制備 帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP) 多克隆抗體制備 抑郁癥動物模型
ELISA(酶聯(lián)免疫吸附法)技術(shù) Western-blot 實驗服務(wù) 脊髓損傷模型
生化指標(biāo)檢測 蛋白雙向電泳實驗服務(wù) 腦外損傷模型
雙熒光素酶報告基因檢測 原核蛋白表達純化 骨神經(jīng)損傷模型
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP) 真核蛋白表達純化 心肌缺血模型
GST pull Down ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) 心力衰竭模型
SLAC蛋白組學(xué) 肺動脈高血壓動物模型
高血壓模型
病毒類 實驗課題整體外包 粥樣動脈硬化模型
過表達/干擾慢病毒包裝純化 整體課題外包 大腦中動脈阻塞模型
過表達/干擾腺病毒包裝純化 細胞整體實驗外包 慢性之氣管炎模型
逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 動物整體實驗外包 過敏性哮喘模型
腺相關(guān)病毒包裝純化 肺炎大鼠模型
肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片 原代細胞培養(yǎng) 肝纖維化模型
細胞因子芯片 骨髓間充質(zhì)干細胞培養(yǎng) 膽結(jié)石模型
生長因子芯片 脂肪干細胞培養(yǎng) 急性胰腺炎模型
信號通路磷酸化水平檢測芯片 心肌成纖維細胞培養(yǎng) 急性腎衰竭模型
BioPlex懸浮芯片 軟骨細胞培養(yǎng) 體內(nèi)血栓模型
生長因子芯片 血管內(nèi)皮細胞培養(yǎng) 關(guān)節(jié)炎模型
炎癥因子芯片 神經(jīng)元細胞培養(yǎng) I型和II型糖尿病模型
血管生成因子芯片 內(nèi)皮組細胞原代培養(yǎng) 裸鼠成瘤
凋亡因子芯片 基因編輯動物
趨化因子芯片 電生理相關(guān)服務(wù) 動物整體實驗服務(wù)
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 膜片鉗實驗
細胞生物學(xué) 高通量測序 代謝組學(xué)
細胞原代培養(yǎng) mRNA測序 氣相色譜GC/MS
MTT檢測 LncRNA測序 液相色譜LC/MS
細胞凋亡檢測 全基因組測序 核磁共震NMR
細胞周期檢測 RNA-Seq測序
細胞克隆形成實驗 外顯子測序 影像學(xué)相關(guān)實驗
Transwell細胞遷移/侵襲 16s擴增子測序 Micro-CT
流式分選 Small RNA測序 小動物活體成像
CCK8/XTT檢測 宏基因組測序 核磁共振
臺盼藍檢測細胞活性 單細胞測序 PET-CT
藥物篩選細胞學(xué)實驗 circleRNA測序
細胞粘附性檢測 甲基化測序 基因編輯動物
細胞劃痕實驗 條件性敲除小鼠/大鼠
細胞生物學(xué)整體實驗 全基因敲除小鼠/大鼠
細胞成管實驗
病理類 CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入 基因芯片
掃描電鏡 基因定點突變細胞系 LncRNA芯片
透射電鏡 單基因敲除細胞系 miRNA芯片
HE染色 多基因敲除細胞系 mRNA芯片
免疫組化 目的基因敲入細胞系 甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
Tunel(原位末端凋亡法)檢測 報告基因敲入細胞系 SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
激光共聚焦 miRNA/LncRNA敲除細胞系
免疫熒光
Masson染色 CRISPR/Cas9動物敲除/敲入
原位雜交 基因敲除大鼠/小鼠
熒光原位雜交 基因敲入大鼠/小鼠
特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等)
行為學(xué)檢測 藥物篩選服務(wù)項目 藥效學(xué)評價
水迷宮實驗 高通量自動藥物篩選平臺 神經(jīng)系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價
曠場實驗 細胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評價
重復(fù)性刻板行為檢測 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)研發(fā)平臺 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價
動物跑臺檢測 分子藥理研究平臺 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價
強迫游泳 生物膜片鉗藥物篩選平臺 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價
常規(guī)藥物體外篩選 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評價

【本平臺合作項目】

分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)、病理染色檢測、細胞敲除&敲入、模式與轉(zhuǎn)基因動物、SPF動物保種、免疫學(xué)檢測、影像學(xué)檢測、原代培養(yǎng)、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、高通量高內(nèi)涵篩選、藥效學(xué)評價、藥理毒理學(xué)實驗、慢病毒包裝與穩(wěn)轉(zhuǎn)株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學(xué)分析、知識產(chǎn)權(quán)服務(wù)!

【全國免費熱線】400-675-6758

【電話】023-65316016,023-65316556

【郵箱】china-western@163.com

【官網(wǎng)網(wǎng)址】m.jnkqjc.com

【地址】重慶市高新區(qū)二郎創(chuàng)業(yè)大道高科創(chuàng)業(yè)園D棟2樓

Agilent miRNA芯片服務(wù)


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