
時間:2020-07-20 14:40:00 瀏覽:46808次
一、lncRNA芯片
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,
lncRNA) 指的是長度在200-100000
nt之間的RNA分子,它們不編碼蛋白,但參與細胞內(nèi)多種過程調(diào)控。人們對lncRNA的認(rèn)識還處在初級階段,lncRNA起初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來的研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過程,與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展和防治都有著密切的關(guān)系。lncRNA的種類遠遠超過編碼RNA,哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是lncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA的比例是1%-5%)。lncRNA已經(jīng)成為非編碼RNA研究領(lǐng)域的一個熱點。
lncRNA研究的重要一步是發(fā)現(xiàn)與特定疾病相關(guān)的lncRNA。傳統(tǒng)的lncRNA篩選方法(SELEX等)效率低下,假陽性率高。而基因芯片具有覆蓋全面、高效、準(zhǔn)確的特點,因此用基因芯片來篩選lncRNA是一種準(zhǔn)確快捷的方法。
二、lncRNA技術(shù)特點:
1)目前市面上探針密度最高的lncRNA芯片產(chǎn)品;
2)芯片采用Agilent
eArray平臺設(shè)計,使用Agilent
SurePrint技術(shù)合成,技術(shù)重復(fù)性高于99%;
3)覆蓋主流數(shù)據(jù)庫所有l(wèi)ncRNA,可同時檢測lncRNA和mRNA,并挖掘兩者之間的關(guān)聯(lián);
4)檢出率高:隨機引物擴增方式,可同時擴增帶Ploy-A和不帶Poly-A的lncRNA,確保更多的
lncRNA被檢測出來;
5)提供完整lncRNA芯片數(shù)據(jù)分析解決方案。
三、lncRNA芯片服務(wù)流程:
1、總RNA提??;
2、反轉(zhuǎn)錄合成cDNA;
3、體外轉(zhuǎn)錄合成cRNA;
4、隨機引物合成正義鏈cDNA
5、DNA片段化,生物素標(biāo)記;
6、芯片雜交、洗滌、染色、掃描。
四、樣本要求:細胞、新鮮組織或總RNA樣品
1、提取RNA量≥1ug;
2、細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存。
3、樣品運輸:細胞或者組織樣品;或者總RNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。
五、應(yīng)用:
篩選差異表達的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注釋、lncRNA調(diào)控機制預(yù)測
六、服務(wù)流程
七、服務(wù)項目
分子生物學(xué)類 | 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) | 動物實驗 |
實時熒光定量PCR | 單克隆抗體制備 | 帕金森疾病模型 |
免疫共沉淀(Co-IP) | 多克隆抗體制備 | 抑郁癥動物模型 |
ELISA(酶聯(lián)免疫吸附法)技術(shù) | Western-blot 實驗服務(wù) | 脊髓損傷模型 |
生化指標(biāo)檢測 | 蛋白雙向電泳實驗服務(wù) | 腦外損傷模型 |
雙熒光素酶報告基因檢測 | 原核蛋白表達純化 | 骨神經(jīng)損傷模型 |
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP) | 真核蛋白表達純化 | 心肌缺血模型 |
GST pull Down | ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) | 心力衰竭模型 |
SLAC蛋白組學(xué) | 肺動脈高血壓動物模型 | |
高血壓模型 | ||
病毒類 | 實驗課題整體外包 | 粥樣動脈硬化模型 |
過表達/干擾慢病毒包裝純化 | 整體課題外包 | 大腦中動脈阻塞模型 |
過表達/干擾腺病毒包裝純化 | 細胞整體實驗外包 | 慢性之氣管炎模型 |
逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 | 動物整體實驗外包 | 過敏性哮喘模型 |
腺相關(guān)病毒包裝純化 | 肺炎大鼠模型 | |
肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
蛋白芯片 | 原代細胞培養(yǎng) | 肝纖維化模型 |
細胞因子芯片 | 骨髓間充質(zhì)干細胞培養(yǎng) | 膽結(jié)石模型 |
生長因子芯片 | 脂肪干細胞培養(yǎng) | 急性胰腺炎模型 |
信號通路磷酸化水平檢測芯片 | 心肌成纖維細胞培養(yǎng) | 急性腎衰竭模型 |
BioPlex懸浮芯片 | 軟骨細胞培養(yǎng) | 體內(nèi)血栓模型 |
生長因子芯片 | 血管內(nèi)皮細胞培養(yǎng) | 關(guān)節(jié)炎模型 |
炎癥因子芯片 | 神經(jīng)元細胞培養(yǎng) | I型和II型糖尿病模型 |
血管生成因子芯片 | 內(nèi)皮組細胞原代培養(yǎng) | 裸鼠成瘤 |
凋亡因子芯片 | 基因編輯動物 | |
趨化因子芯片 | 電生理相關(guān)服務(wù) | 動物整體實驗服務(wù) |
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 | 膜片鉗實驗 | |
細胞生物學(xué) | 高通量測序 | 代謝組學(xué) |
細胞原代培養(yǎng) | mRNA測序 | 氣相色譜GC/MS |
MTT檢測 | LncRNA測序 | 液相色譜LC/MS |
細胞凋亡檢測 | 全基因組測序 | 核磁共震NMR |
細胞周期檢測 | RNA-Seq測序 | |
細胞克隆形成實驗 | 外顯子測序 | 影像學(xué)相關(guān)實驗 |
Transwell細胞遷移/侵襲 | 16s擴增子測序 | Micro-CT |
流式分選 | Small RNA測序 | 小動物活體成像 |
CCK8/XTT檢測 | 宏基因組測序 | 核磁共振 |
臺盼藍檢測細胞活性 | 單細胞測序 | PET-CT |
藥物篩選細胞學(xué)實驗 | circleRNA測序 | |
細胞粘附性檢測 | 甲基化測序 | 基因編輯動物 |
細胞劃痕實驗 | 條件性敲除小鼠/大鼠 | |
細胞生物學(xué)整體實驗 | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
細胞成管實驗 | ||
病理類 | CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
掃描電鏡 | 基因定點突變細胞系 | LncRNA芯片 |
透射電鏡 | 單基因敲除細胞系 | miRNA芯片 |
HE染色 | 多基因敲除細胞系 | mRNA芯片 |
免疫組化 | 目的基因敲入細胞系 | 甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本) |
Tunel(原位末端凋亡法)檢測 | 報告基因敲入細胞系 | SNP芯片(限人和小鼠來源樣本) |
激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除細胞系 | |
免疫熒光 | ||
Masson染色 | CRISPR/Cas9動物敲除/敲入 |
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原位雜交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | |
熒光原位雜交 | 基因敲入大鼠/小鼠 |
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特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等) |
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行為學(xué)檢測 | 藥物篩選服務(wù)項目 | 藥效學(xué)評價 |
水迷宮實驗 | 高通量自動藥物篩選平臺 | 神經(jīng)系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價 |
曠場實驗 | 細胞高內(nèi)涵藥物篩選平臺 | 抗腫瘤藥物藥效學(xué)評價 |
重復(fù)性刻板行為檢測 | 蛋白質(zhì)組學(xué)靶標(biāo)研發(fā)平臺 | 心血管系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價 |
動物跑臺檢測 | 分子藥理研究平臺 | 泌尿系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價 |
強迫游泳 | 生物膜片鉗藥物篩選平臺 | 內(nèi)分泌系統(tǒng)藥物藥效學(xué)評價 |
常規(guī)藥物體外篩選 | 抗炎免疫藥物藥效學(xué)評價 |
【本平臺合作項目】
分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)、病理染色檢測、細胞敲除&敲入、模式與轉(zhuǎn)基因動物、SPF動物保種、免疫學(xué)檢測、影像學(xué)檢測、原代培養(yǎng)、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、高通量高內(nèi)涵篩選、藥效學(xué)評價、藥理毒理學(xué)實驗、慢病毒包裝與穩(wěn)轉(zhuǎn)株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學(xué)分析、知識產(chǎn)權(quán)服務(wù)!
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