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iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation）技術(shù)是由美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司ABI 研發(fā)的一種多肽體外標(biāo)記技術(shù)。

SILAC的是分別用天然同位素(輕型)或穩(wěn)定同位素(重型)標(biāo)記的必需氨基酸取代細(xì)胞培養(yǎng)基中相應(yīng)氨基酸，細(xì)胞經(jīng)5-6個(gè)倍增周期后，穩(wěn)定同位素的氨基酸完全摻入到細(xì)胞新合成的蛋白質(zhì)中替代了原有氨基酸。不同標(biāo)記細(xì)胞的裂解蛋白按細(xì)胞數(shù)或蛋白量等比例混合，經(jīng)分離、純化后進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。

Label free是—蛋白質(zhì)非標(biāo)記標(biāo)記技術(shù)越來越受到關(guān)注，它克服了傳統(tǒng)的同位素標(biāo)記的缺點(diǎn)，即過高的樣品濃度, 復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)方案及價(jià)格過高的原料等，該方法具有速度更快，更簡(jiǎn)潔及更簡(jiǎn)明的結(jié)果等優(yōu)點(diǎn)，大有取代同位素標(biāo)記技術(shù)。

SWATH技術(shù)具有靈敏度高，重現(xiàn)性強(qiáng)，準(zhǔn)確度高，高通量，線性動(dòng)態(tài)范圍大等優(yōu)點(diǎn)。

蛋白質(zhì)經(jīng)過蛋白酶的酶切消化后成肽段混合物，在質(zhì)譜儀中肽段混合物電離形成帶電離子，質(zhì)譜分析器的電場(chǎng)、磁場(chǎng)將具有特定質(zhì)量與電荷比值（即質(zhì)荷比，M/Z）的肽段離子分離開來，經(jīng)過檢測(cè)器收集分離的離子，確定每個(gè)離子的M/Z值。經(jīng)過質(zhì)量分析器可分析出每個(gè)肽段的M/Z，得到蛋白質(zhì)所有肽段的M/Z圖譜，即蛋白質(zhì)的一級(jí)質(zhì)譜峰圖。